Milli Eğitim Bakanlığı'ndan sorumlu Genel Başkan Yardımcısı Suat Özçağdaş, Genel Başkan Yardımcısı Gamze Taşcıer, Milletvekilleri, Parti Meclisi üyeleri ve partililer, Ankara Bölge İdare Mahkemesi'ne başvurarak dava açtı. Başvurunun ardından yapılan açıklamalarda, söz konusu protokolün eğitim sistemini olumsuz etkilediği ve çocukların geleceğini tehlikeye attığı vurgulandı.
CHP Çanakkale Milletvekili İsmet Güneşhan, konuya ilişkin açıklamasında, "Okullarımız Bakanın çiftliği, tarikatların ve ideolojik yapıların arka bahçesi değildir. Hukuk dışı ve çocuklarımızın geleceğini karartmaya dönük tüm girişimlerin karşısında olmaya devam edeceğiz" dedi. Güneşhan, eğitimin bağımsız, çağdaş ve bilimsel temellerde ilerlemesi gerektiğinin altını çizerek, hukuki ve toplumsal mücadelelerinin devam edeceğini belirtti.
CHP, protokolün iptal edilmesi gerektiğini savunarak, eğitimin tüm ideolojik müdahalelerden arındırılması için kararlı olduklarını ifade etti.